阿尔金山自然保护区位于阿尔金山南部，东昆仑山北部，西起若羌和且末两县分界线，东至新疆与青海两省区交界处，北到阿尔金山南部的祁曼塔格山，南为新疆与西藏分界的东昆仑山脉，东西长360公里，南北宽190公里，总面积为44940平方公里。
阿尔金山保护区内，四周高山环绕，其中慕士塔格峰，海拔高达6973米。现代冰川、高原湖泊和高原沙漠与种类繁多的藏野。驴、藏羚、野牦牛、野骆驼及黑颈鹤、藏雪鸡、白肩雕、玉带海雕等珍禽异兽，连同241种野生植物，蔚为高原奇观。
阿尔金山的河、湖、泉阿尔金山保护区内主要有8条河流组成了高原盆地中的“大动脉”，滋润着广阔的高山草场。8条主要河流的的流域面积达两万平方公里。河流的水量补给主要的两种即冰川融水和出露泉水。
保护区内河流形态各异，直泻湖盆；有的时而潜入地下，时而冒出地面，缓缓向盆地洼地汇集；有的水质纯洁；有的矿化度高达71.5克/升。苏鲁贝提勒克河为保护区的河流，原于新青峰北坡，注入阿牙克库木湖，全长280公里，流域面积达6250平方公里。
保护区湖泊星罗棋布，总面积1200平里，占保护区面积的2.7%，对调节区内气候起着重要作用。阿牙克库木湖位于保护区北部，面积536平方公里；阿其克库勒湖位于保护区西部，面积352平方公里，矿化度81.6克/升，湖中屹立着两个小岛，远远望去，犹如劈波斩浪前进的舰艇。
岛上居住着大量的鸟群。鲸鱼湖位于保护区南部，以形似鲸鱼湖而得名。库木湖和克其克库木湖，维吾尔语称“沙子湖”和“小沙子湖”，位于库木库里沙山上；湖水为沙山凝聚水和基岩裂隙水补给，水质良好，矿化度为0.3克/升，**有进出口水的淡水湖伊阡巴达湖，又称“依协克帕提湖”，面积11.8平方公里，形如葫芦，水质较好，湖中生长着钩虾等多种水生生物，湖周围一片菌绿，这里是保护区内**有牧民居住的地方，也是“鸟类的天堂”。
积沙滩小湖群在沙丘链分隔的海拔4900米高的沙漠中，呈月牙形分布着145个小湖泊，保护区内还有多处冰河期残留的冰川终碛湖。受构造断裂裂隙控水作用和断层阻水影响，保护区南北侧地下水量差异很大，沿断裂走向南侧，有多处断裂泉。
在石灰岩底层涌出的泉水，是很好的地下水资源。保护区东北部库木库里沙山北麓坡角的沙子泉，有3口高在3920米的泉眼，其东、南、西三面被沙山环绕，呈向北开口的漏斗。较大的泉眼直径在200米以上，其它两口为50米。
泉水为下降泉特点，由坡角一线以数千股散流溢出，若人立泉水中，动则下陷。明布拉克，即“千泉”之意，由近千口泉眼散布在洼地边缘而得名。这里水草丰茂，是动物寻食的好场所。其火山活动区，尚有多处待探明的高山温泉。
岩溶地貌在阿尔金山自然保护区的阿尔格山中，有一片古老的岩溶地貌，东起布喀达坂山峰，西至阿其克库勒湖，长350公里，宽20-30公里，面积约10000平方公里，深藏在海拔4400-5000米的崇山峻岭之中。
这一片古老的石灰岩山经过千百年的风吹雨打，溶解分化，呈现**奇百怪的形状。林立的石峰，有的拔地而起，直插蓝天；有的像骆驼、大象、苍龙、卧虎、笔架、天桥、庙宇、点将台、仙人掌、石旗杆、拴马桩，惟妙惟肖；
还有千姿百态的溶沟、石芽、甬道、走廊。阿尔金山的岩溶地貌，由于局部地区受到第四纪冰川的影响，形成了“静扫群山出，突兀撑青空”的角峰。保护区的岩溶地貌套叠冰川地貌，崖壁奇峭，冰川悬挂，气象万千。
进入阿尔金自然保护区首先映入眼帘的是环绕高原盆地的冰峰雪山，它那巍峨壮观的雄姿，为保护区增添了无限的魅力。高原盆地周缘的高山，发育着现代冰川，北缘祁曼塔格山脊线，南缘木孜塔格峰至新疆一侧，共有冰川388条，面积达78.3平方公里，流向保护区的冰川总贮量为678.2亿立方米。
木孜塔格峰和新青峰是现代冰川集中发育地域，冰川面积占保护区冰川总面积的77.5%，厚度在100米以上。这里冰川类型多样，有悬冰川、冰斗冰川、山谷冰川、坡面冰川、平顶冰川等。
有的好似凝固的浪涛，有的好似静卧的群羊，有的龙骨错落、弧拱迭起犹如琉璃瓦垄，有的高悬山恰似朵朵白云绕山间，大自然创造的冰雪奇景使人眼花缭乱。木孜塔格峰和新青峰不仅以冰雪世界为保护区增添风采，更是国内外登山者勇于攀登的目标。
魔鬼谷魔鬼谷在阿尔金山自然保护区东端，若羌县与青海省交界处的昆仑山区，西起库木库里沙漠，东到布仑台，全长100公里，宽30公里，海拔3000-4000米。
南有高耸入云的昆仑山主脉，北有祁曼塔格山阻挡着柴达木盆地夏季干燥而炎热的空气，两山夹峙，雨量充足，气候湿润，那棱格勒河穿越其中，大小湖泊星罗棋布，牧草繁茂，好似一条绿色的地毯。
然而，就是这个景色迷人的峡谷，却被人们视为有魔鬼的禁区，充满着恐怖的气氛。在当地流传着许多关于“魔鬼”的神秘传说：“当黑云笼罩着山谷，伴随着电闪雷鸣，即可看到蓝莹莹的鬼火，听到猎人求救的枪声和牧民及挖金者绝望而悲惨的哭嚎”。
因而，人们都远离这神奇的地方，并把那棱格勒（太阳沟）改叫为“魔鬼谷”。经科考人员考察，发现魔鬼谷是一个雷击区，这里有大面积强磁性的玄武岩，还有大大小小30多个铁矿脉及石英体。
由于湿空气受昆仑山主脉和祁曼塔格山脉的阻挡，汇集谷内，形成雷雨云，加上地下磁场的作用，常产生“雷暴”现象。魔鬼谷之谜引起人们极大的兴趣，人们正在努力探索，以期尽快揭开魔鬼谷之谜。
高原沙漠奇观位于若羌县境南部的阿尔金山自然保护区内的沙漠奇观堪称一绝，其中尤以东北部的库木库里沙漠和鲸鱼湖东部的积沙滩新月形沙丘尤为著称，库木库里沙漠面积达2556平方公里，呈不规则长方形，
横卧在祁曼塔格山南麓，海拔高程在3916-4706米之间，主要由高大的金字塔沙丘与复合形新月形沙丘组合而成，沙漠厚度平均300米。
积沙滩新月形沙丘位于鲸鱼湖以东，巍巍雪山以北，海拔高程达4800-5000米，面积120平方公里，它比南美洲阿塔卡玛沙漠（海拔3000米左右）还要高出近2000米左右。该沙漠掩埋了近代河床及冰积物，活动性较大，至今仍在堆积上升。
沙丘底部潜水极为丰富。水依新月形沙丘而汇聚，集成月牙形水泊，名曰“月牙泉”。夏季形成小湖，碧蓝清澈；冬季封冻结冰，白如银月，大可与敦煌鸣沙山的月牙泉争奇斗艳。
鲸鱼湖奇景在若羌县东南部的昆仑山腹地，平卧着一个神奇的大湖，它东西长37公里，南北宽7.6公里，面积260平方公里，湖面海拔高达4708米，湖深1-10米。湖水与雪山冰峰相互辉映，湖的形状恰似一条横卧着的肥大鲸鱼，头东尾西，故而得名“鲸鱼湖”。
湖的东段七分之一处，形成了一道长达7.5公里的自然砂砾提，将湖水自然的分隔成东、西两部分。砂砾提宽约200米，高出湖面2-4米，中间有缺口，两侧之水可以互通。东半湖“鱼头处”因有玉浪河大物多，每年夏季，都有无数的棕头鸥和赤麻鸭等飞禽在此觅食繁育。
西半湖“鱼身处”因无淡水补给，天长日久，蒸发强烈，湖水含盐量几乎达到饱和状态，是一个没有生命的死湖。由于两湖水质差异明显，自然形成东湖“鸥歌鸭舞”、西湖“万马齐喑”的鲜明对比，因此，人们又把鲸鱼湖叫做“阴阳湖”。
阿尔金山国际狩猎场狩猎场位于距且末县城150公里的阿尔金山北麓的塔特勒克苏与江尕勒萨依之间地区，平均海拔在3000米左右，面积为100平方公里，山体陡峭，剥蚀严重。山地植被有昆仑蒿、昆仑针茅、芨芨草等。河谷地带长有胡杨、芦苇、拂子茅、唐克特百刺。
1993年4月26日国家林业部正式批准成立阿尔金山狩猎区且末猎场。狩猎场对国内外游客开放，狩猎者办理应有手续就可进入。
