萨迦寺位于日喀则西南130公里处的萨迦县城里，是萨迦派第一座寺院，由萨迦的创始人昆·贡却杰布于公元1073年创建。萨迦寺是全国重点文物保护单位之一。寺中艺术珍品浩瀚，文物价值又极高，因此被人们称为“第二个敦煌”。
萨迦寺分南北两寺，以仲曲河为界，北寺修在北岸苯波山前，始建于宋神宗元丰二年（1079年），北寺规模宏大，为一片重叠逶迤的建筑群，在“文革”中遭到毁灭性破坏。现在只有萨迦南寺尚存。星罗棋布的村舍沿山脚向平原展开，直至与县城连接起来。那些别致的房屋有秩序地排列着，古朴的街巷也很有规矩，这种形制独特的村舍在西藏可并不多见。
萨迦南寺坐落在日喀则地区萨迦县仲曲河南岸的平原上，始建于1268年，面积为14700平方米，平面呈正方形。有两圈城墙，城墙上有垛口，为了利于防守，除修有坚固的寺墙外，还修建了四个城堡和四个角楼，远远望去，对称、壮观。外面还有护城河，城门为“工”字形，整个平面图是大“回”字套着小“回”字，颇有一点战争防御的味道。
城墙的颜色除了紫红色以外，还间有黑、白两色，这是萨迦教派的重要标志。紫红色象征文殊菩萨，黑色象征金刚0神，白色象征观音菩萨。三色成花，因而俗称“花教”，这在藏区现存的古建筑中独具一格。萨迦南寺内珍藏着大量具有历史和艺术价值的文物，如封诰、印章、佛像等。萨迦寺的元代壁画总计有上万平方米，以萨迦法王像和曼陀罗最有特色，仅曼陀罗壁画就有130多幅。
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