哥特式教堂在新大陆是罕见的，但波多黎各却有两个：一个是1606年建在圣赫尔曼（San Germán）的博塔科里教堂，另一个就是16世纪30年代建在圣胡安旧城的圣琼斯教堂。圣琼斯教堂作为岛上的第一个教堂，也是西半球最古老的教堂。尽管最初的建筑曾在飓风中被吹走，现在的教堂仍可追溯到19世纪。圣琼斯教堂最初是多米尼克会的修道院和小礼拜堂，是为圣托马斯•阿奎那（Saint Thomas Aquinas）而建的，1865年耶稣会士接管后被更名。
无论用哪一个名字，圣琼斯教堂都是一个引人关注的地方，其哥特式的建筑细节给人留下了深刻的印象。历史和艺术爱好者们将可以看到波多黎各的第一任总督胡安•庞塞•德莱昂（Juan Ponce de Léon）捐赠的16世纪的木制十字架。15世纪的祭坛是从西班牙的加的斯（Cadiz）带到圣胡安来的。波多黎各最著名的艺术家琼斯•坎佩切（José Campeche）就葬在这里。胡安•庞塞•德莱昂最初也是躺在这里安息的，但后来他的遗体被迁移到圣胡安大教堂中一个更雅致的地方了。他的徽章挂满了一面墙，而他的雕像，1797年从英国人手里捕获大炮的青铜铸雕像，伫立在教堂前的一个小广场的中央。
还有一定要参观一下隔壁的多明各会修道院（Dominican Convent）。于1523年建在庞塞•德莱昂捐赠的土地上的它曾是修道院、兵营和美国的军事指挥部。如今，它是波多黎各文化学会（Puerto Rico Institute of Culture）的所在地，在这还举办了多场音乐会和展览会。
