草鞋山遗址，位于苏州城东15公里吴县唯亭镇东北2公里陵南村北、阳澄湖南岸650米处。地面有两座紧邻的土墩，一名草鞋山，高10.5米，一名夷陵山，高15.23米。1973年钻探初步查明，遗址中心区域东西长260米，南北宽170米，面积4.4万平方米，相当于两个土墩面积的3倍。
遗址为1956年的江苏省文物管理委员会在文物普查时发现，1972～1973年南京博物院两次发掘，总共发掘面积1050平方米。清理了新石器时代的居住遗迹，11个灰坑（窖穴）和206座墓葬，出土陶、石、骨、玉等质料的生产工具、生活用具、装饰品等共1100多件。
遗址的文化堆积最厚处达11米，可分为10个文化层，从地层迭压关系可以看出文化层的先后次序是：马家浜文化、崧泽文化，良渚文化，直到进入春秋时代的吴越文化。这一地层关系，对于确定太湖地区史前文化的发展序列，为研究长江下游、太湖流域的古代文化提供了标尺，具有典型意义。
马家浜文化层放射性碳素断代并经校正的年代，为公元前4300～前4000年左右。发现墓葬100多座，以单人俯身葬为主，并有同性合葬墓。头向多朝北，有些头骨用陶器覆盖或置于陶器中；随葬器物较少，大多数是一件食器，或用炊器和食器各一件，食器主要用豆或钵，炊器用釜或鼎。发现有碳化粳、籼稻谷。出土碳化纺织品3块，经鉴定是以野生葛为原料，纬线起花的罗纹织品。这是目前所知中国年代最早的纺织品实物。
崧泽文化层内发现墓葬89座，盛行单人仰身直肢葬，并发现两座成年男女合葬墓。头向大多朝南。大部分墓葬有数量不等的随葬品，多者25件，有的墓仅有象征性的陶片随葬。随葬品以陶器为主，一般由炊器、食器和盛器组成，常见的是鼎、豆、壶、罐、杯等，有生产工具和玉石装饰品，个别墓随葬有猪下颌骨。
良渚文化层发现一座大型墓葬，人骨已朽，似为男性，并附葬2个二次葬的女性。墓外还殉葬一狗，随葬大量精致的器物，有玉琮、玉璧、玉镯、玉串饰、石器工具和刻纹陶器等共60多件，显示了当时物质文化的发展和所处原始社会解体的迹象。
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